Frank Black (Lance Henriksen) ist ein Profiler und ehemaliger FBI-Agent, der die Fähigkeit besitzt, sich so sehr in Mörder hineinzuversetzen, dass er die Welt kurzzeitig quasi durch deren Augen sieht und so ihre Taten und Motive unmittelbar nachverfolgen kann. Nachdem er nach einem Nervenzusammenbruch seinen FBI-Dienst quittiert hat und mit seiner Frau Catherine (Megan Gallagher) und seiner Tochter Jordan (Brittany Tiplady) nach Seattle gezogen ist, wird er von der mysteriösen Millennium-Gruppe angeheuert, die aus verschiedenen früheren Mitgliedern von US-Sicherheitsbehörden besteht und es sich zur Aufgabe gemacht hat, die Aufklärung von Gewaltverbrechen voranzutreiben. Gemeinsam mit dem Millennium-Verbindungsmann Peter Watts (Terry O'Quinn), der ihm beratend zur Seite steht, drängt sich Frank immer mehr der Verdacht auf, dass die Zunahme an grausamen Delikten etwas mit der nahenden Jahrtausendwende zu tun hat. Doch je mehr Frank der Sache nachgeht, desto offensichtlicher wird es auch, dass die Millennium-Organisation ganz eigene finstere Ziele verfolgt.