Armeeoffizier Joe Armstrong (Michael Dusikoff) kennt sich mit Ninjas aus, denn der Soldat wurde einst in der fernöstlichen Kampfkunst geschult. Er ist immer dann zuständig, wenn es darum geht, Gefangene hinter feindlichen Linien zu befreien. Sein neuester Auftrag führt ihn und seinen Kollegen Curtis Jackson (Steve James) auf eine Karibikinsel, wo er das Verschwinden einiger Marines untersuchen soll. Dabei trifft er auf den Superkriminellen Leo "The Lion" Burke (Gary Conway). Dieser hat einen Wissenschaftler namens Professor Sanborn entführt, der ihm eine Armee von mutierten Ninjas züchtet - die gehorchen jedem Befehl und sind extrem gefährlich. Ein Militärschlag wird verweigert, sodass Joe die Sache selbst in die Hand nehmen muss. Unterstützung bekommt er dabei von Alicia (Michelle Botes), der Tochter Sanborns.
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