In einer alternativen Realität werden Kriege im feudalen Japan mit Magie und High-Tech-Waffen ausgefochten. Inmitten dieses Chaos möchte Yasuke (Lakeith Stanfield), der stärkste Ronin des Landes, der wegen seiner dunklen Hautfarbe auch als der Schwarze Samurai bekannt ist, seine blutige Vergangenheit hinter sich lassen und in Frieden leben. Doch das Schicksal gibt ihm keine Auszeit. Denn ein nahegelegenes Dorf wird zum Zentrum eines brutalen Konfliktes. Yasuke muss erneut zum Schwert greifen, um ein mysteriöses Kind zu retten, das von dunklen Mächtigen und wahnsinnigen Kriegstreibern verfolgt wird.
Die Anime-Serie basiert lose auf dem Leben des realen Yasuke, der als erster afrikanisch-stämmiger Samurai in die Geschichte einging und unter dem legendären Feldherren Oda Nobunaga diente. Nach dessen Tod streifte Yasuke als Ronin durch das Land. Die Serie knüpft an diese Geschehnisse an, fügt dem ganzen aber Fantasy und Sci-Fi-Elemente hinzu.