Bei einem Bombenanschlag in Flushing, New York werden zahlreiche Menschen verletzt und getötet. Es scheint sich um die Nachahmung eines fünf Jahre früher passierten Verbrechens zu handeln. Bei ihren Nachforschungen stößt Sherlock Holmes (Jonny Lee Miller) mithilfe eines alten Klienten Dr. Joan Watsons (Lucy Liu) schnell auf den Verantwortlichen der damaligen Tat, der offenbar in enger Beziehung zum jetzigen Hauptverdächtigen, dem Bauunternehmer Nathan Resor (Matthew Del Negro) steht. Doch Resors Alibi scheint wasserdicht zu sein.