Ohne dass sie noch eine Erinnerung an den erwachsenen Peter (Joshua Jackson) besitzen, müssen die Fringe-Teams aus den beiden Universen zusammenarbeiten. Doch das ohnehin brüchige und kaum vorhandene gegenseitige Vertrauen wird schnell auf die Probe gestellt, als Olivia (Anna Torv) im hier eine Mordserie untersucht, die Verbindungen zur anderen Seite aufweist. Der Fall führt sie mit FBI-Agent Lincoln Lee (Seth Gabel) zusammen, an den sie allerdings auch keine Erinnerungen mehr hat.