Der Computerexperte Walter O’Brien (Elyes Gabel) zählt zu den intelligentesten Menschen der Welt. Finanziell sieht es für das Genie allerdings nicht so rosig aus. Der von ihm geleiteten Gruppe von brillanten Technik-Experten, zu der der Statistik-Experte Sylvester Dodd (Ari Stidham), die Ingenieurin Happy Quinn (Jadyn Wong) und der Verhaltensexperte Toby Curtis (Eddie Kaye Thomas) gehören, mangelt es an lukrativen Aufträgen. Doch ändert sich alles, als eines Tages der Homeland-Security-Agent Cabe Gallo (Robert Patrick) mit der Bitte an sie herantritt, eine verheerende Katastrophe zu verhindern. Das von ihnen gebildete Team "Scorpion" sieht sich fortan als letzte Verteidigungslinie zwischen den Menschen und den gefährlichen Bedrohungen der Moderne. Bei all den globalen Problemen sorgt die alleinerziehende Kellnerin Paige (Katharine McPhee) immer wieder dafür, dass die Super-Hirne den Bezug zum normalen Leben nicht verlieren.