In der Fortsetzung der Komödie „Ein Hund namens Beethoven“ verliebt sich der Bernhardiner Beethoven in die Bernhardiner-Dame Missy. Die beiden Hunde haben sich an einem Eisstand kennen gelernt. Unglücklicherweise gibt es Ärger zwischen Missys Herrchen und dessen Ex-Frau Regina (Debi Mazar), da die Scheidung der beiden nicht reibungslos verläuft. Regina nimmt Missy mit zu sich nach Hause. Da Beethovens Gefühle mit ihm durchgehen, folgt der Hund seiner Angebeteten und trifft sich heimlich mit Missy. Die Liebesgeschichte bleibt nicht ohne Folgen, so dass schon bald vier kleine Welpen auf die Welt kommen. Da Regina und ihr Liebhaber Floyd (Chris Penn) kein Interesse an den Hundebabys haben, schnappen sich die Kinder von Beethovens Herrchen George Newton (Charles Grodin) die Welpen, bevor etwas Schlimmes passiert. Als Familie Newton einen Kurzurlaub macht, treffen sie auf Regina, die Böses Im Schilde führt.
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