Die Erniedrigung von irakischen Gefangenen in Abu Ghraib wurde auf Fotos dokumentiert, die im Frühjahr 2004 an die Öffentlichkeit gelangten. Oscar-Preisträger Errol Morris machte sich daran, in einer mehrjährigen Recherche die Hintergründe der Taten aufzuklären.
Den Hauptteil von „Standard Operating Procedure“ bilden umfangreiche Interviews, geführt mit fünf der sieben verurteilten US-amerikanischen Militärs. Die Äußerungen der Zeugen und Täter wurden mit der "Interrotron"-Technik eingefangen, die Zuschauer guckt den Interviewten also direkt in die Augen.
Morris setzt auf Erlebnisberichte aus erster Hand und ergänzt diese Segmente durch Auszüge aus den Briefen, die Specialist Sabrina Harman aus Abu Ghraib an ihre Lebensgefährtin schrieb. Dazu kommen noch die Beweisfotos selber - und die unter Kritikern sehr umstrittenen Nachstellungen, Spielszenen sowie Illustrationen.