Der renommierte Neurologe und Psychiater Dr. Lee Rosen (David Strathairn) hat es sich zur Aufgabe gemacht, eine Gruppe seltener Menschen mit übernatürlichen Fähigkeiten, die er Alphas nennt, anzuleiten, damit diese mit ihren Kräften im alltäglichen Leben besser zurechtkommen, vor allem aber um mit ihrer Hilfe Verbrechen aufzuklären, in die andere Alphas verwickelt sind. Gemeinsam arbeiten sie für eine kriminologische Unterabteilung des US-Verteidigungsministeriums. Im Laufe ihrer Arbeit müssen sie bald feststellen, dass eine terroristische Vereinigung namens Red Flag, die eigentlich seit mehreren Jahren als zerschlagen galt, Alphas benutzt, um schwere Verbrechen zu begehen. Rosen und sein Team, zu dem unter anderem der über eine außergewöhnliche Körperbeherrschung verfügende Ex-Marine Cameron Hicks (Warren Christie), die zu Gedankenkontrolle fähige Nina Theroux (Laura Mennell) und der mit einer gesteigerten Kraft ausgestatte ehemalige FBI-Agent Bill Harken (Malik Yoba) gehören, setzen daher alles daran, Red Flag das Handwerk zu legen.