14 Jahre nachdem die Akte X geschlossen wurde, nimmt Dana Scully (Gillian Anderson) auf Bestreben von FBI Assistent Director Walter Skinner (Mitch Pileggi) Kontakt zu Fox Mulder (David Duchovny) auf. Die beiden sollen einen Fall untersuchen, den der rechspopulistische Verschwörungstheoretiker Tad O'Malley (Joel McHale) ihnen nahelegt. Er bringt sie mit Sveta (Annet Mahendru) zusammen, die behauptet, ihr seien mehrfach Föten von Aliens geraubt worden und sie besäße inzwischen selbst außerirdische DNA...