Als Kind ist James Gordon (Ben McKenzie), der zu einem späteren Zeitpunkt in seinem Leben zum (aus verschiedenen Batman-Filmen bekannten) Polizei-Chef wird, in einem Außenbezirk von Gotham aufgewachsen. Nun kehrt er zurück in die von ihm romantisierte Stadt, in der sein Vater einst erfolgreich als Anwalt gewirkt hat und mit der er viele schöne Erinnerungen verbindet. Als Police Detective geht er einem neuen Job nach und will die Metropole mit Mut und Ehrlichkeit wieder zu einstiger Größe verhelfen. Zusammen mit seinem Partner, der aufdringlichen, aber cleveren Polizei-Legende Harvey Bullock (Donal Logue), stößt er auf einen großen Fall: der Mord an den Milliardären Dr. Thomas und Martha Wayne (Grayson McCouch und Brette Taylor). Am Tatort begegnet Gordon ihrem 12-jährigen Sohn Bruce (David Mazouz), der dieses unsägliche Verbrechen mit ansehen musste. Von dem Schicksal des Jungen bewegt, schwört er den Mörder dingfest zu machen. Zwischen dem Polizisten und Bruce, der von nun an von Butler Alfred Pennyworth (Sean Pertwee) aufgezogen wird, entwickelt sich eine besondere Freundschaft.
Auf der Suche nach dem Verbrecher und im Verlauf seiner Laufbahn als Gesetzeshüter trifft Gordon auf zwielichtige Gestalten wie Gangster-Boss Fish Mooney (Jada Pinkett Smith) und viele Menschen, die später zu Gothams berühmtesten Bösewichten werden - wie Oswald Cobblepot alias Penguin (Robin Lord Taylor), Selina Kyle alias Catwoman (Camren Bicondova) und Edward Nygma alias Riddler (Cory Michael Smith).