Weil sie nach der Tötung des verräterischen Homeland Security-Agenten John Russo (Ivan Sergei) an ihrer Eignung für die Arbeit beim Navy CIS zweifelt, quittiert Meredith Brody (Zoe McLellan) überraschend den Dienst in New Orleans' Investigativeinheit. Neu zum Team von Dwayne Cassius Pride (Scott Bakula) stößt dafür die FBI-Agentin Tammy Gregorio (Vanessa Ferlito). Die gerät in eine schwierige Lage, denn das FBI beginnt in Zusammenhang mit Russos Tod und Brodys Abschied interne Ermittlungen, unter anderem gegen Prides Team. Gregorio kämpft somit an zwei Fronten...