Im viktorianischen England erzählt die junge Alice von ihren Abenteuern in einem geheimnisvollen Wunderland, in dem es nur so vor Fabelwesen und mystischen gestalten wimmelt. Die konservativen Ärzte halten Alice Geschichten, die sich um Wasserpfeife rauchende Raupen, unsichtbare Katzen und sprechende Spielkarten ranken, für absurde Hirngespinste und beschließen, sie mit einer neuartigen Behandlung zu kurieren, die ihre Erinnerungen an das surreale Märchenland für immer auslöschen soll. Alice willigt ein, um die schmerzhaften Erinnerungen an ihre große Liebe, den mysteriösen Flaschengeist Cypher, hinter sich zu lassen, obwohl sie weiterhin fest daran glaubt, dass ihre Gefühle und Erinnerungen real sind. Doch bevor es zu spät ist, wird Alice von dem Herzbuben und dem Weißen Kaninchen vor ihrem grausamen Schicksal bewahrt. Gemeinsam reisen sie durch den Kaninchenbau zurück ins Wunderland, in dem nichts unmöglich scheint.