Tief im Dschungel einer einsamen Insel im Pazifik hausen mehrere Exemplare einer mutierten, giftigen Schlangenart. Dr. Andrea Swanson (Krista Allen) und ihr Assistent Jake (Louis Mandylor) sollen die Spezies im Auftrag der US-Regierung untersuchen, um ein ultimatives Gegengift zu entwickeln. Als es jedoch zu Spannungen mit dem chinesischen Militär kommt, lässt Admiral Bradley Wallace (Tom Berenger) die Insel sofort evakuieren. Um nach Hause zu gelangen, müssen die beiden Forscher eine Schiffreise an Bord eines alten U-Boots unter der Leitung von Lt. Commander James O'Neill (Luke Perry) auf sich nehmen. Andrea bringt für spätere Experimente einige Versuchsobjekte mit an Bord und Jake schmuggelt gar einige der mutierten Schlangen. Während eines Angriffs gelingt es den tödlichen Tieren jedoch aus ihrem Gefängnis zu befreien. Da sie wegen einer möglichen Provokation der Chinesen nicht auftauchen können, müssen sie sich nun tief unter Wasser mit den aggressiven Killerschlangen auseinandersetzen.
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