In der zweiten Staffel begibt sich die entschlossene Ingenieurin Juliette (Rebecca Ferguson) auf die Suche nach Antworten zum Mord an einem geliebten Menschen. Dabei stößt sie auf ein erschütterndes Geheimnis, das weit über ihre Vorstellungskraft hinausgeht. In einer Welt, in der die Wahrheit ebenso tödlich sein kann wie die Lügen, wagt sie sich in die gefährlichen Ruinen einer postapokalyptischen Umgebung jenseits des Silos. Währenddessen droht ein Aufstand gegen den machthungrigen Anführer Bernard Holland (Tim Robbins) auszubrechen, und Juliette gerät mitten in die eskalierenden Spannungen.