1952 ruft die US-Regierung eine geheime Behörde ins Leben, die die immer häufiger gemeldeten UFO-Sichtungen in Amerika unter die Lupe nehmen soll. Der Name des Projekts lautet „Blue Book“ und es wird geleitet von Professor Dr. J. Allen Hynek (Aiden Gillen), der gemeinsam mit seinem Partner Captain Michael Quinn (Michael Malarkey) die Fälle wissenschaftlich erklären soll. Die Quote der nicht mit einfachen Mitteln plausibel zu erklärenden Fälle ist jedoch so hoch, dass Hynek beginnt, an der Ehrlichkeit seiner Auftraggeber zu zweifeln und eine Vertuschungsaktion vermutet.