Die Baulelaire-Waisen Klaus (Louis Hynes), Violet (Malina Weissman) und Sunny (Presley Smith) sind drauf und dran, die letzten Geheimnisse rund um den Tod ihrer Eltern in einem mysteriösen Feuer zu lüften. Doch ihr Onkel Graf Olaf (Neil Patrick Harris) gibt einfach nicht auf, seiner schmalen Chance, doch noch an das Erbe der Kinder zu gelangen, hinterherzujagen und macht ihnen das Leben zur Hölle.
In dieser finalen Staffel der Serie werden die Lemony Snicket-Bücher "The Slippery Slope", "The Grim Grotto" und "The Penultimate Peril" adaptiert.