Ein Ufo taucht über Tokio auf. Es kommt aus dem 23. Jahrhundert, um Japan endgültig von Godzilla zu befreien. Um das Unheil zu verhindern, dass das Monster in Zukunft noch über das Land bringen wird, will die dreiköpfige Besatzung mit Hilfe drei Japaner aus Tokio in das Jahr 1944 zurückreisen und Godzilla schon bei seinem ersten Auftauchen ...