Im dritten Teil der Cube-Serie wird das Geheimnis des "Cubes" gelüftet: Der Mechanismus des Würfels wird von Leuten hinter dem Vorhang gesteuert. Als einer davon, Eric Wynn (Zachary Bennett), sich in die im Cube eingesperrte Cassandra Rains (Stephanie Moore) verguckt, beginnt er die Mechanismen jedoch zu hinterfragen. Vor allem versucht Eric Lichts ins Dunkel zu bringen, nach welchen Voraussetzungen die Menschen ausgewählt werden, die sich schließlich im Cube den zahlreichen Todesfallen stellen müssen. Dabei kommt Eric einigen Unregelmäßigkeiten auf die Spur, die deutliche Zweifel an der offiziellen Version erzeugen. Gleichzeitig versuchen der Soldat Haskell (Martin Roach), die Ärztin Jellico (Terri Hawkes), Bartok (Richard McMillan), Meyerhold (Mike 'Nug' Nahrgang) und Rains den Ausgang aus dem Cube zu finden.
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