Eine tödliche Alien-Armee nähert sich der Erde mit der Absicht, diese einzunehmen. Die riesige Schildkröte Gamera, welche seit jeher die Menschheit vor etwaigen Bedrohungen beschützt, greift ein und zerstört ihr Schiff. Kurz vorher gelingt es den Aliens noch gerade rechtzeitig, ein Signal an ihre Heimat zu senden und Gamera als ihren erklärten Feind auszuweisen. Einige Zeit später nähert sich ein zweites Schiff, deren Besatzung sowohl Gamera als auch die Pfadfinder Jim (Carl Craig) und Masao (Tôru Takatsuka) in die Finger bekommt. Die Außerirdischen nehmen die Jungs als Geiseln, da sie um Gameras Schwachpunkt wissen, nämlich dass er um jeden Preis verhindern will, dass Kinder zu Schaden kommen. Mit Hilfe eines Kontrollchips am Kopf wird er nun als Marionette der Aliens genutzt, um die Stadt Tokio anzugreifen. Jim und Masao eilen der sanften Riesenschildkröte zu Hilfe, doch dann müssen es die drei noch mit dem Anführer der Aliens auf sich nehmen: ein riesiger Tintenfisch namens Viras.
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