Mit Blut am Körper wird der katholische Priester Andrews (Von Flores) an einem Tatort vorgefunden, wo gerade jemand ermordet wurde. Er kommt in Untersuchungshaft. Obwohl er seine Unschuld beteuert, glaubt man ihm nicht recht. Priesterkollege Daniel Clemens (Christian Slater) gegenüber offenbart Andrews, dass er den wahren Mörder kennt, ihn jedoch wegen des Beichtgeheimnisses nicht verraten will. Clemens will Beweise dafür sammeln, dass Andrews unschuldig ist - der sich mittlerweile erhangen hat.
In der ehemaligen Gemeinde des Toten beginnt Clemens seine Recherche, unterstützt von der Journalistin Madeline Finney (Molly Parker) und gegen den Willen der Vorgesetzten. Welche dunklen Geheimnisse lauern hinter den alten Kirchenmauern und wie tief kann Clemens dort graben, bevor es gefährlich für ihn wird?
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